Materialen voor het experiment, Check hiernaast of je alles hebt...

• Één recording laptop
• Twee rode meetelektrodes (deze kunnen al aangesloten zijn)
• Één gele aarde, vanaf hier ground-elektrode genoemd
• De blauwe referentie-elektrode
• Meetapparatuur (zie beneden, sectie apparatuur)
• Elektrodeplakkertjes, tape, EEG-gel en een injectiespuit

EN.... Heb je alles?

Volgorde van opstarten

1. Controleer de verbindingen, of ze zoals in afbeelding 6 zijn aangesloten. Mist er iets, waarschuw je assistent.
2. Start de recording-computer (rechts) op.
3. Controleer de WIFI. Deze is nodig voor licentie verificatie door Matlab.
4. Start MATLAB R2007B op.

Identifying setup components

Scan the picture to identify essential components

Afbeelding 6: De EEG setup

OPSTARTEN VAN HET EEG_RECORDER PROGRAMMA

Voor experiment II wordt alleen de Recording-computer gebruikt

1. Start MATLAB-32bits op. De data acquisitie van de EEG_recorder software draait NIET op 64 bits
2. Zorg dat de ‘Current Directory’ verwijst naar de folder ‘EEG recorder_Master’
3. Laad nu het programma ‘EEG_recorder.m’ door het naar het ‘Command Window’ te slepen of door EEG_recorder in het ‘Command Window’ in te tikken en op enter te drukken. Niet dubbel klikken op het programma– je opent dan de code en loopt gevaar deze per ongeluk te veranderen zodat het programma niet meer werkt.
4. Het programma start op.

AANSLUITEN ELECTRODES

1. Selecteer een proefpersoon
2. Plak een elektrodeplakker op de elektrode en verwijder de folie die de andere kant van het plakkertje beschermd.
3. Bevestig nu elektrodes op de rechterarm:
4. Plak meetelektrode 1 op de Extensor Digitorum (afbeelding 7) Je kan deze vinden door je pols omhoog te bewegen.
5. Plak meetelektrode 2 op de Palmaris Longus (afbeelding 7). Je kan deze vinden door je pols naar beneden te bewegen.
6. Plak de gele groundelektrode centraal op het voorhoofd, met het draadje horizontaal.
7. Zet alle draadjes met tape vast op de huid, zodat er niet aan de elektrodes wordt getrokken.
8. Vul de injectiespuit met de contactgel en vul alle elektrodes met de gel (zie afbeelding onder links).
9. Plaats een doperwt gel op de referentie-elektrode en plaats deze op de rechteroorlel (zie afbeelding onder rechts).

Afbeelding: Het ‘gellen’ van de elektrodes.

Afbeelding 7: De spieren van de onderarm. De activiteit van de Extensor Digitorum en die van de Palmaris Longus worden in dit experiment gemeten.

INSTELLEN RECORDING-COMPUTER Motoriek :

Als alle elektrodes zijn bevestigd kan het signaal worden getest. Allereerst moeten de EEG kanalen en de registratie van de DIOs worden aangegeven (zie afbeelding 8).

Afbeelding 8: Het linker instellingspaneel van de EEG_Recorder. 'View EEG channels' en 'record TTLs' zijn interactief, 'DAQ settings' zijn standaard ingesteld.

1. Klik channel 3 t/m 8 uit. Zie afbeelding 8. Er zijn 2 elektrodes aangesloten dus moeten er ook 2 kanalen worden gemeten.
2. Check of de aangesloten elektrodes inderdaad naar Channel 1 en 2 op de GAMMABox gaan
3. Klik alle DIOs uit, Zie afbeelding 8. Deze hebben we alleen nodig in Experiment IV, waar ook de functie van de DIO's wordt gegeven.
4. De DAQ settings zijn standaard ingesteld en hoeven niet te worden aangepast. Note: sampling rate = 256 samples/s

Afbeelding 9: Het interactieve ‘Live view’ instellingspaneel van de EEG_Recorder.

1. ‘Preview sample length’ = 1024 samples. Er worden 1024 datapunten op het scherm getoond. Met een sampling rate van 256 samples/s komt er 4 seconden data van elke elektrode in beeld.
2. ‘Channel spacer’ default = 10. Hoe kleiner de channel spacer, hoe meer de signalen uitvergroot worden. Zet de Channel Spacer voor het motoriekpracticum op 1.
3. Hou de ‘FFT sample length’ gelijk aan de ‘Preview sample length’. De FFT wordt dan berekend over het signaaldeel dat op het scherm wordt weergegeven.
4. Zet de ‘FFT frequency range’ van 0.1 tot 60 Hz

Afbeelding 10: Het Clear/Start/Stop menu van de EEG_Recorder.

Zet de ‘Duration acquisition (s)’ op de gewenste tijd.

1. Zet voor het testen de tijd op 600 seconden
2. Aan het einde van deze tijd stopt de acquisitie en kan het signaal worden gesaved.
3. Het is altijd mogelijk om eerder te stoppen (zie beneden: Stop EEG).

• CLEAR: Voor een meting wordt gestart gooit CLEAR de buffer (dus je tijdelijke dataopslag) en het scherm leeg. De instellingen blijven behouden.
• LET OP: Gebruik nooit CLEAR als je de data nog moet saven! Je bent dan alles kwijt.
• Start EEG: De acquisitie start.
  • LET OP: Wees geduldig. Het duurt even (enkele seconden) voordat het signaal ook werkelijk verschijnt op het scherm en de groene LED op de MOBILab continue brandt.
  • De opname stopt automatisch als de ’Duration acquisition’-tijd is verstreken.
  • De hele registratie van alle 8 kanalen (ook de niet gemeten kanalen) verschijnt dan in beeld
  • SAVE de data: File > Save.
  • LET OP: Niet gesaved is alle data weg! Doe dit dan ook meteen, ga daarna pas discusseren, praten, etc.
• Stop EEG: Als je tijdens de acquisitie de meting wilt stoppen voordat de ‘Duration acquisition’ tijd is verstreken.
  • Let OP: Wees geduldig. Het duurt even (enkele seconden) voordat de meting is gestopt. Pas als de hele registratie van alle 8 kanalen (ook de niet gemeten kanalen) in beeld verschijnt, kan je de geregistreerde data SAVEN. Wacht hierop voordat je IETS anders doet.
  • SAVE de data: File - Save, in de folder die door het programma wordt geopend, de data folder.
• DAQ settings zijn standaard ingesteld en hoeven niet te worden aangepast.

1. Start een nieuwe meeting
2. Laat de proefpersoon nu eerst een paar keer de pols alternerend naar boven en naar beneden bewegen met steeds een paar seconden ertussen.
3. Bekijk het signaal.
4. Stop de meting, wacht totdat het programma alle data verwerkt heeft en naar het scherm geplot. Dat duurt even: Wees geduldig!
5. SAVE de data: File > > Save, in een folder op de desktop. Dat wordt jullie data folder.Gebruik hier uit ‘privacy’-redenen nooit de naam van de proefpersoon, maar bijvoorbeeld een geanonimiseerd nummer en een korte beschrijving van het proefje: ‘ppn1_arm1’. Gebruik geen spaties of andere vreemde karakters in de naamgeving. Beperk je tot letters, cijfers en underscores(_)
6. Reset nu de EEG_recorder (door op ‘clear’ te drukken).

1. Om een kanaal te plotten ga naar Tools >  Plotting tool in EEG_recorder
2. Load je datafile vanuit jullie datafolder.
3. Plot columns
4. Laat de ‘Onset(s)’ leeg, deze heb je straks wel nodig bij de ERP analyse van Experiment IV
5. Rows columns to plot (verwijder 1:8 en zet het kanaalnummer van je interesse erin):
   • Kanaal 1 voor Extensor Digitorum
   • Kanaal 2 voor Palmaris Longus
6. Plot elk kanaal apart met de ‘plotting tool’
7. Maximaliseer de plots

Als de EEG_recorder weer meet, laat de proefpersoon dan een vuist maken en langzaam steeds meer kracht zetten tot maximaal, ontspan dan weer. Doe dit 10 keer met enige tijd er tussen. Stop de meting, sla de data op in je datafolder, en plot zoals hierboven.

We hebben nu gezien hoe we de kracht die op een spier wordt gezet kunnen meten. Er zijn nog andere fysiologische metingen die we kunnen meenemen en die gebruikt kunnen worden om bv fysieke stress te meten. Dit is handig aangezien we in experiment III de relatie tussen vermoeidheid van spieren en fysieke stress gaan bepalen. In het volgende deelexperiment gaan we twee van deze maten bekijken:

Extra materiaal: 2 extra meetelektrodes

Dit is de tijd om een andere proefpersoon aan te sluiten 

We gaan straks in Experiment III spiervermoeidheid meten van de Extensor Digitorum en de Palmaris

Plak meetelektrode 3 naar een plek net boven de rechter wenkbrauw.

Plak meetelektrode 4 op de binnenkant van de linker pols, tussen de pezen en de buitenkant van je arm. Dus op de plek waar je je hartslag kan voelen.

Zet electrode 3 en 4 ook aan in EEG_Recorder en Start nu de meting weer op.

Je mag de proefpersoon aangesloten laten voor Experiment III

Dit experiment wordt uitgevoerd door één deelnemer van de groep

Extra materiaal:

• 1 tennisbal of iets om in te knijpen

De electrodeconfiguratie is zoals aan het eind van experiment II.

Test nu eerst het signaal

• Start de EEG_recorder weer op (zie experiment 1)
• Maak eerst het signaal zoveel mogelijk storingsvrij (trouble shoot zoals in Exp II).
• Het signaal moet er ongeveer uitzien als in afbeelding 11, met een extra spierkanaal.
• Als het signaal naar tevredenheid is stop dan de meting, CLEAR de buffer en het scherm.

Afbeelding 11: Zoals de meting eruit kan zien. Hier kanaal 1: hartslag, Kanaal 2: EMG en kanaal 3: Oogknippers

Doe nu het feitelijke experiment

Geef nu de proefpersoon de geltube in de rechterhand. Laat de tube op de tafel staan en knijp de tube losjes tussen de wijsvinger en de duim. Hou de andere vingers in een vuist. Laat de proefpersoon nu naar een leeg/wit scherm kijken met een muis in het midden om de in vraag 3.4 geziene verstoringen te vermijden.

• Start een nieuwe meting met een duur van 10 minuten.
• Wacht eerst minimaal 60 seconden voor een stabiele ‘baseline’, zonder de tube al in te knijpen.
• Laat vervolgens de proefpersoon de tube optillen en zo hard mogelijk in de tube knijpen en dit 5 minuten volhouden (dus houd de tijd bij).
• Laat na 5 minuten, of als de proefpersoon niet meer kan, de tube op tafel terugzetten en de tube wederom losjes vasthouden.
• Meet nadat de proefpersoon gestopt is met samenknijpen nog minimaal één minuut door. Ontspan daarbij de vingers, maar houd de tube vast.
• Stop de meting.
• SAVE de data!
• Overleg even met je assistent of er nog tijd is om dit experiment te herhalen met andere personen in de groep.
•  
• Bespreek na de eerste proefpersoon de analyse (zie beneden) met de hele groep.
• Deel daarna de groep op om eventueel een tweede persoon te meten. Eén persoon is natuurlijk proefpersoon, één persoon houdt de meting in de gaten, één persoon zorgt voor de proefpersoon (zodat deze niet wordt afgeleid etc. – laat je proefpersoon dan ook nooit alleen) en de overige mensen voeren de analyse van de al vergaarde data uit. Zorg ervoor dat iedereen elke rol een keer heeft.

DATAVERWERKING en ANALYSE

Om de data te kunnen analyseren gaan we ‘old school’ te werk, d.w.z. we meten het signaal op het scherm met een liniaal.

• Om een kanaal te plotten ga naar Tools > Plotting tool
• Load je datafile
• Plot columns
• Rows columns to plot (verwijder 1:8 en zet het kanaalnummer van je interesse erin):
• 1 voor Extensor Digitalis data
• 2 voor Palmaris Longus data
• 3 voor oogknipper data
• 3 voor hartslag data
• Plot elk kanaal apart met de ‘plotting tool’ voor elke proefpersoon
• Maximaliseer de plots

Bespreek met je groep goed van te voren hoe de data te analyseren en welke parameters van belang zijn (Vraag III.6).

Bespreek jullie analyse protocol met je assistent.

Interpreteer de resultaten. Maak gebruik van de theorie uit de colleges en de referenties in het CANVAS document.

Bespreek de resultaten met je assistent.

Aan het eind van het experiment verwijder alle elektrodes en de gel. Let ook hier weer op dat je de draadjes van de elektrodes niet te erg buigt.

Dit experiment wordt in iedergeval uitgevoerd door één deelnemer van de groep.

We gaan nu de volledige setup die voor jullie staat gebruiken; Materialen:

• Twee laptops (Recording en stimulatielaptop)
• Vier meetelektrodes en een aarde en referentie electrode
• Meetapparatuur
• EEG-gel, elektrodeplakkertjes, tape
• Muziek op telefoon of IPOD

STIMULUS COMPUTER

Om de key-presses te kunnen registreren en te koppelen aan de spierpotentialen gebruiken we het stimulatieprogramma 'Stimulus Presenter' op de stimulus computer. Stimulus Presenter is ontwikkeld door Erwin Diepgrond, nav het EEG-practicum in zijn 2e jaar van de opleiding Psychobiologie. "Moeten we daarmee werken, dat kan toch veel beter?" En ja, het kon veel beter.

'Stimulus Presenter' kan plaatjes laten zien, geluid afspelen, tekst laten zien etc etc. Verder kan het ook reacties van de proefpersoon opslaan. Wij gaan deze laatste feature gebruiken.

De Experimentele opzet: Wat willen we bereiken

• 'Stimulus Presenter' detecteert de onset van elke keypress
• Deze keypress wordt omgezet in een digitale puls
• Deze puls wordt uitgestuurd naar de Digital Input/Output (DIO) box
• Via een door ons geselecteerde poort op de DIO wordt een marker (TTL) uitgestuurd naar de recording computer.
  • TTL, kort voor Transistor-Transistor Logic is een standaard digitale communicatiepuls tussen electronische apparaten en circuits.
  • Het ontvangende apparaat leest het ontvangen signaal (0= maximaal 0.8 Volt, 1 = minimaal 2.0 Volt) uit.
• Op deze manier zetten we markers onder het EEG/EMG signaal in de recording Laptop op de onset van de keypresses op de stimulus computer.
• Het programma 'EEG_recorder' knipt de EEG/EMG data op grond van die marker onset.
• De geknipte stukjes worden gemiddeld.

Daarvoor configureren we 'Stimulus Presenter' op de stimulus computer zo dat deze de start van elke keypress registreert en doorgeeft aan de recording computer.

Nu hebben we het experiment voor jullie voorgekookt. Tijdens het 2e jaars L&G en EEG practicum gaan jullie zelf mbv 'Stimulus Presenter' een eigen experiment in elkaar zetten.

voor Neuroanatomie en Neurofysiologie cursus:

• Start MATLAB 64-bits. Stimulus presenter draait alleen in een 64 bits omgeving.
• Zorg dat de ‘Current Directory’ in MATLAB verwijst naar het programma ‘Matlab_Stimulus_presenter_master' in de ‘Matlab_Stimulus_presenter_master_motoriek' folder op de desktop.
• Laad nu het programma door 'start.m' naar het ‘Command Window’ te slepen. Het programma start op.
• We gaan nu alleen de 'start experiment' functie gebruiken.
• Uitleg over alle functies van 'Stimulus Presenter' kan je HIER vinden.

voor Neurosystemen cursus:

• Zorg dat de ‘Current Directory’ in MATLAB verwijst naar het programma ‘Matlab_Stimulus_presenter_master' in de ‘Matlab_Stimulus_presenter_master' folder op de desktop.
• Laad nu het programma door 'start.m' naar het ‘Command Window’ te slepen. Het programma start op.
• creeer een nieuw experiment waarbij je de 'Bind key to DIO' gebruikt om een keypress onset naar de recording computer te sturen
• start je experiment
• Note: het scherm wordt zwart en je gemaakte experiment werkt, echter je kan het alleen maar afsluiten door CTRL-ALT-DEL te gebruiken
• Kijk nu of de DIO's binnenkomen op je recorder
• Uitleg over alle functies van 'Stimulus Presenter' kan je HIER vinden.

Afbeelding 12: Stimulus Presenter Startmenu

INSTELLEN VAN DE EEG_RECORDER SOFTWARE

Elke keer dat een specifieke toets wordt ingedrukt op de stimuluslaptop wordt een TTL-puls via de DIO-box naar de recordingcomputer gezonden. Deze wordt echter alleen door de EEG_recorder opgenomen als de desbetreffende DIO-2 in de EEG-recorder is aangezet (afbeelding 13). De verbinding tussen de DIO-box en de recording-PC is reeds gemaakt. In tegenstelling tot de EEG-kanalen worden de DIO-kanalen alleen opgeslagen als ze aan staan.

Afbeelding 13: TTL-puls panel in EEG_recorder. In dit panel kun je kiezen welke DIO je gebruikt. In het hier gegeven geval staat alleen DIO 2 aan en wordt dus opgenomen. De data van alle andere DIOs wordt niet opgeslagen.

Testen connectie stimulus computer met de recording computer

Zet om te testen het stimulatieprogramma aan.

• Start het experiment op de stimuluslaptop
• De connectie met de DIObox wordt geconfigureerd en de DIOkanalen worden geladen.
• Het scherm wordt zwart en vanaf dat moment staat alles gereed.
• Voor het vervolg van het experiment kan je de stimulus laptop programma gewoon door laten lopen. 
• Start de registratie van de EEG_recorder. Wacht tot het signaal binnenkomt.
• De markerkanalen worden toegevoegd aan de meetelektrodekanalen en zijn zichtbaar vanaf kanaal 9.
• Zodra het signaal loopt press meerdere malen de 'm' toets op de stimuluslaptop.
• Bevestig dat de keypresses als markers worden geregistreerd op het DIO1 kanaal
• Voor het vervolg van het experiment kan je de stimulus laptop programma gewoon door laten lopen.
•  
• Is het toch noodzakelijk te stoppen gebruik dan de '/' toest.
• Als de stimuluslaptop niet reageert, kan je het alleen maar afsluiten door CTRL-ALT-DEL te gebruiken, Helaas.

Voor Neurosystemen cursus: Plaats nieuwe electrodes op lokatie C3 en C4 en je gele ground op CZ

Voor NeuroAnatomie en Neurofysiologie cursus: Pak nu de EEG-Cap met de reeds geplaatste elektrodes

Kies nu uit je groep een nieuwe proefpersoon.

We gaan nu ook de aansturing van de motorcortex in beeld brengen.

• Plaats electrodes op lokatie C3 en C4 en de gele elektrode (de ground) op CZ
• Zet bij de proefpersoon de EEG cap met de reeds geplaatste elektrodes op het hoofd.
• Bepaal Inion en Nasion (zie afbeelding 14) en verzet de Cap zodat de CZ elektrode (De gele aarde) halverwege zit tussen deze twee locaties. Dit is de internationale standaard van plaatsen van electrodes, het 10-20 systeem.

Afbeelding 14: Links de locatie van CZ elektrode t.o.v. Nasion en Inion. Rechts de standaard plaatsingsmogelijkheden van de elektrodes.

• Plak meetelectrode 1 op de Digitorum extensor
• Plak meetelectrode 2 op de Palmaris longus
• Plak weer alle draadjes van de elektrodes vast met tape zodat ze niet kunnen breken.
• Zet ook de referentie vast op de oorlel.
• De gele aarde elektrode zit nu in de Cap op locatie Cz
• Maak contact met de huid op alle elektrodes (Zie afbeelding 15)

Afbeelding 15: Het ‘gellen’ van de elektrodes.

• Laat de EEG_recorder runnen en zorg voor een stabiel, storingsvrij signaal.
• De kwaliteit van het signaal moet er uitzien zoals in afbeelding 11

VAN DE MOTOR CORTEX NAAR DE KEYPRESS

Nu gaan we onderzoeken hoe de keypress, de spierpotentialen en de aansturing vanuit de motorcortex in de tijd verloopt. We hebben daarvoor ongeveer 500-600 keer een keypress nodig.

Om de test niet te saai te maken laten we de proefpersoon meetikken op de maat van een Slow-Blues of elk nummer dat 60 of minder beats per minuut heeft. In totaal duurt het hele experiment ongeveer 10-12 minuten. Herhaal het nummer of geef een tweede-derde nummer om de tijd vol te maken. Laat de proefpersoon nu zijn/haar onderarm op de tafel leggen.

• Als het goed is verlopen draait het experiment nog steeds op de stimulus laptop.
• Stel de looptijd van het recording programma in op 20 minuten (1200 seconden).
• Start de EEG_recorder.
• Check het signaal.
• Controleer nog even of het stimulusprogramma nog steeds werkt. Gebruik daarvoor de 'm' key.
• Werkt alles en is het signaal nog naar wens: even een nieuwe meting starten (Stop, clear, start).
• Start de muziek.
• Neem zoals in experiment III een korte basismeting op zonder keypresses!
• Laat dan de proefpersoon herhaaldelijk op de 'm' toets drukken in de maat van de muziek.
• Als er ongeveer 10 minuten voorbij zijn kan de proefpersoon stoppen met drukken.
• Wederom neem weer enige tijd een basismeting op zonder keypresses
• Stop nu de EEG meting
• Wacht tot alle informatie uit de buffer op het scherm is verschenen
• SLA DE RECORDINGDATA NU OP.
• Herhaal dit eventueel voor proefpersoon 2.

DATA ANALYSE

Kijk nu even terug naar vraag IV.2 en teken nog eens wat de timing is van de individuele signalen die jullie gemeten hebben.

Bespreek dit met jullie assistent.

DATA ANALYSE in 5 logische stappen

De dataanalyse verloopt in het algemeen in een aantal logische stappen.

• Wegfilteren van ongewenste frequenties
• Knippen van de data, waardoor individuele ERPs ontstaan
• Basislijncorrectie om de individuele ERPs rondom de 0-lijn te centreren
• Middelen van de uitgeknipte en gecorrigeerde ERPs
• Visualisatie van de verkregen gemiddelde ERPs

Hieronder lopen we ze in volgorde door.

STAP 2: KNIPPEN VAN DE DATA 

De tweede stap is het knippen van de data in korte stukjes op basis van de onset van de keypress. Hiervoor gebruiken we de ‘Event cutter’.

• Open ‘Event cutter’ in de EEG_recorder onder tools.

Elke keer dat een toets werd ingedrukt werd een TTL-puls naar de recordingcomputer gestuurd. We willen de data dus gebaseerd op de TTL-pulsen knippen. Hiervoor moeten we de data die we net hebben gemeten eerst inladen.

• Laad de data: File -- load.

De TTL-pulsen van het toetsenboard zijn opgeslagen in kanaal 9 of 10. Dit is afhankelijk van hoeveel markerkanalen (DIOs) je hebt gebruikt; de eerste acht kanalen zijn altijd de EEG kanalen en dan één kanaal per marker in volgorde. Met de huidige opstelling zijn er dus maximaal 14 kanalen actief (8 EEG/EMG kanalen en 6 markerkanalen).

• Selecteer op welke kanaal je marker van de Keypress is binnengekomen. Vul dat kanaalnummer in het eerste vakje van de Event_cutter-scherm (zie afbeelding 16).

Nu heb je als het goed is in vraag IV.2 bedacht dat de spierpotentiaal rond de 100 á 200 ms duurt en vlak vóór de TTL puls plaats vindt. Daarnaast zal de motorcortex ongeveer 500 ms voor de keypress plaatsvinden. We zijn dus vooral in de periode vóór de puls geïnteresseerd.

• Knip de data daarom 1000 ms voor de TTL en 500 ms na de TTL. Let op, de eenheid is hier ‘samples’ (hoeveel samples per seconde kunnen we met dit systeem ook alweer meten?).

Afbeelding 16: Event_cutter. Invulschema voor de Event_cutter. Op basis van het tweede markerkanaal (column 10) worden hier 1000 ms voor de puls en 500 ms na de start van de keypress geselecteerd, eruit geknipt, en opgeslagen.

• Press ‘cut’, je knipt nu de data rondom de onset van de keypress.
• Sla deze data op onder de oude naam maar met de toevoeging _cut (gebruik geen spaties, Matlab kan daar niet tegen). Sla het op in je datafolder op de desktop.

STAP 3: BASISLIJN CORRECTIE VAN DE ERPs

Sluit nu de ‘Event_cutter’ af.

De volgende stap is een basislijn correctie van de geknipte stukjes data, de ERPs. Dit kun je doen met behulp van de ERP tool (wederom te vinden onder tools).

• Open ‘ERP tool’ in de EEG_recorder onder tools.


Afbeelding : ERP_Tool. Voor het bewerken en analyseren van ERPs.

• Laad eerst de net geknipte file (File -- Load).
• In het groene kader: De eerste twee dimensies van je dataset zijn meetpunten in de tijd en de verschillende kanalen. In de (nieuwe) derde dimensie zitten de verschillende stukjes die we net hebben geknipt. Van deze stukjes data willen we de basislijn corrigeren
• In het blauwe kader: Hier geef je aan wat je als basislijn beschouwt en waar de getriggerde data zit.
• ONSET in sample nr: vul hier 64 samples in, dat komt neer op 250 ms (sample frequency: 256 samples per seconde). We nemen dus de eerste 250 ms van elke ERP als een basislijn of controlemeting.
• Het principe van basislijn correctie: We hebben steeds 1.5 seconden data geknipt uit de hele file. Als je er vanuit gaat dat er bv een lage oscillatie met een amplitude van 100 microvolt en een frequentie van 2 Hz door de data loopt dan kan het zijn dat sommige ERPs zijn geknipt als de lage oscillatie op zijn piek is, en soms ook als de lage oscillatie in het dal zit. In het eerste geval start de ERP op 50 microVolt, in het tweede op -50microVolt. De basislijn correctie neemt het gemiddelde van amplitude van de eerste 250 ms van elke ERP en corrigeert de amplitude van de gehele ERP met dit getal naar 0 microVolt.
• Click nu op Baseline Correction: Elke ERP wordt nu gecorrigeerd met zijn eigen basislijnwaardes.
• Sla deze data op onder de oude naam maar met de toevoeging _bl (gebruik geen spaties, Matlab kan daar niet tegen). Sla het op in je datafolder op de desktop.

De data is nu basislijn gecorrigeerd.

STAP 4: MIDDELEN VAN DE DATA

De volgende stap is het middelen van de data. Dit kun je doen met behulp van de Array_manipulator (wederom te vinden onder tools).

• Open ‘Array Manipulator’ in de EEG_recorder onder tools.
• Laad eerst de net basislijn gecorrigeerde file (File -- Load).

De eerste twee dimensies van je dataset zijn meetpunten in de tijd en de verschillende kanalen. In de (nieuwe) derde dimensie zitten de verschillende stukjes die we net hebben geknipt. Hierover willen we middelen.

• Kies daarom onder ‘Average along dimension:’ ‘3rd dimension’ en druk op ‘Average’.
• De 3e dimensie verdwijnt nu.
• Sla deze data op onder de oude naam_filt_cut_bl met de toevoeging _avg (gebruik geen spaties, Matlab kan daar niet tegen). Sla het op in je datafolder op de desktop.

De data is nu gemiddeld over alle ERPs .

STAP 5: PLOTTEN VAN DE DATA

We houden nu nog 8 kanalen (alle EEG kanalen) met telkens 1500 ms data over. Deze 1500 ms zijn gemiddeld over alle signalen 1000 ms voor en 500 ms na de keypress.

• Sluit nu ‘array manipulator af’.

Ten slotte kunnen we de data eindelijk bekijken. Gebruik hiervoor de Data_plotter (zoals gebruikelijk te vinden onder tools).

• Open ‘Data plotter’ in het Tools menu
• Laad je data_cut_avg file.
• Kies eerst voor de ‘columns’ 1 (het eerste van de vier datakanalen van je proefpersoon) en set de ‘Onset (s)’ op 1 s (dan zit de ‘X-axis’ op de plek waar de TTL puls werd doorgegeven en dus de keypress heeft plaats gevonden) en druk op ‘Plot’.
• Sluit de plots niet
• Herhaal dit voor kanalen 2, 3 en 4

EINDE VAN DIT MOTORIEK PRACTICUM: Bedankt en tot Ziens!